Il Pilates può essere praticato senza particolari rischi anche se, prima di accedere al proprio corso di livello, è necessario un certificato medico di sana e robusta costituzione a seguito di una visita medica. Due o anche tre lezioni alla settimana della durata di circa 60 minuti da scegliere se in gruppo o singolarmente con il proprio personal trainer sono sufficienti a ottenere dei risultati visibili nel giro di alcune settimane.
Le controindicazioni più importanti del metodo Pilates, sono a carico di alcuni soggetti in gravidanza e per coloro che hanno problemi legati alla schiena come per esempio gravi problemi di ernie, discopatie e similari. In questo caso, il Pilates deve essere deciso quale strategia medica, insieme al proprio fisiatra o ortopedico. Il pilates può essere integrato, essendo un’attività anaerobica, alla corsa e alla cyclette nei casi in cui non ci siano limitazioni fisiche per queste ultime attività aerobiche.